1、對粉碎機機艙的清洗。粉碎機機艙也就是我們所說的“粉碎倉”，物品粉碎都在粉碎倉里來進行，所以是重點清洗的部位。粉碎倉與電機的主要固定部位在機艙內部的“刀頭”部位。刀頭上面由一個不銹鋼螺絲固定，只要用扳手把這里的螺絲松開，把刀片拿下來，就可以把機艙和電機分離，分離的時候注意把鏈接線拔下來。粉碎倉的清洗工具涉及專用扳手、毛刷等。粉碎機都配有專用扳手，正好方便拆卸刀頭時使用。請大家在中藥粉碎機清洗的時候用清水清洗，不要用其它清洗劑，最多可使用洗潔精來進行清洗，洗完后要用干抹布擦干。
2、對研磨清洗的其他部分：主要對與螺旋蓋和外部部件進行清洗粉碎機。這些地方都可以用來刷毛刷輕輕刷干凈，必要時用水或清潔劑來清潔它。將產品噴水浸濕，然后倒入洗滌液，將洗滌液與水之間攪拌均勻，也就能均勻的布滿產品的表面，這樣，污垢也就在這個過程中慢慢的沒有那么黏住中藥粉碎機了。小型家用粉碎機可以將刷子浸濕，開始刷洗表面以及內部，這樣的清洗會使得污垢在瞬間大部分的脫離該產品，無論是表面的還是內部的。這個過程完成之后，就拿清水沖洗粉碎機，避免已經脫落的污垢再次污染該產品，因為造成二度附著的現象是比較糟糕的。
還有一種方法是使用清洗機進行中藥粉碎機清洗，將清洗機內注滿水和洗滌劑，然后將需要清潔的中藥粉碎機放入其中。之后清洗機就開始運作了，里面的水流會產生強大的流動力，這樣使得粉碎機內部的污垢大量的脫落且由于水的快速流動而不易再次附著在上面，效果也是非常的理想。中藥粉碎機之后用清水清理干凈，再進行相關的干燥工作，以免水分遺留時間過長造成不必要的損失。
